自從連鎖經營模式在我國發(fā)展以來，一批醫(yī)藥連鎖經營企業(yè)相繼出現，然而專家們指出，物流的滯后已成為擴大連鎖經營的重要障礙。目前為發(fā)展醫(yī)藥連鎖經營在構建現代物流體系中，存在著諸多阻礙因素：如物流觀念落后，缺乏戰(zhàn)略性物流體系構建規(guī)劃；物流基礎薄弱，物流技術整合落后；物流信息化進程落后；第三方物流組織缺乏和能力薄弱等都有待進一步完善和發(fā)展。成本過高使得醫(yī)藥連鎖經營步履維艱。
　　 自建配送中心規(guī)模小
　　 我國醫(yī)藥連鎖業(yè)目前尚處在起步階段，流通的社會化和現代化程度不高，再加上受傳統(tǒng)自給自足、“小而全”的醫(yī)藥流通體制的影響，當前國內醫(yī)藥連鎖業(yè)的物流問題已成為制約醫(yī)藥連鎖經營發(fā)展的瓶頸之一。
　　 廣州是藥品零售市場成熟的城市，藥店多過米鋪，競爭白熱化，地區(qū)的“價格沖突”無可避免。有業(yè)內人士估計，目前國內醫(yī)藥商業(yè)的平均毛利率跌到僅0．5％左右。醫(yī)藥連鎖企業(yè)自建配送中心的費用占銷售額約1％—2％，是除租金、水電費用和人員工資外的第三大成本支出，商家琢磨著：如果能取消內部配送，實現社會配送，縮減的成本可不是個小數目。
　　 廣州市海王星辰醫(yī)藥有限公司在廣州的連鎖網絡鋪得很大，現有47家分店，為了支撐整個連鎖系統(tǒng)的運轉，建立配送中心花了不少力氣。海王星辰總經理趙東強稱，其廣州辦事處辦公室有兩層樓，其中一層就專門用來做配送中心，上面冷藏室、冷凍庫等一個都不能少。而單配送中心的員工就有幾十人。每個門店要貨都得向配送中心申請，再由配送中心向供應商拿貨。趙東強表示，為提高醫(yī)藥連鎖企業(yè)的門檻，“10家以上分店，自備配送中心”是政府的兩個硬條件。但由于自建配送中心規(guī)模小，不專業(yè)，反應不直接，導致配貨時間慢，差錯率高。物流成本成為企業(yè)成本中心
　　 醫(yī)藥流通企業(yè)的利潤占醫(yī)藥行業(yè)利潤的大部分，但目前賺錢的企業(yè)不多，醫(yī)藥流通全行業(yè)的銷售利潤率不到1％，全國30個省市有15個省出現總體性虧損。有統(tǒng)計表明，中國的醫(yī)藥流通企業(yè)費用率非常高，其毛利率平均為12．69％，費用率平均為12％左右，很多醫(yī)藥流通企業(yè)虧損嚴重。廣東本草藥業(yè)作為廣東省流通企業(yè)的“龍頭”之一，目前正迅速擴充連鎖門店及構筑銷售網絡，同時也面臨藥品配送問題的考驗。據本草藥業(yè)連鎖有限公司黨委書記王東才介紹，醫(yī)藥連鎖企業(yè)的三大主要業(yè)務是藥品采購、開門店及藥品配送，配送中心成本高且不穩(wěn)定一直拖企業(yè)發(fā)展的“后腿”，成為企業(yè)的成本中心。據深圳市藥品監(jiān)督管理局統(tǒng)計顯示，2002年深圳市藥品銷售額為95億元，藥品的流通費用卻占成本的15％。只要降低一個百分點，節(jié)約的費用相當于全市目前多個行業(yè)內中小企業(yè)的全部純利潤。物流設施低水平重復建設
　　 與缺乏全國性的藥品分銷物流企業(yè)相對應，我國藥品連鎖零售企業(yè)也僅停留在小賣店的分散經營階段，藥店布局不合理，大多集中于城區(qū)，特別是城區(qū)中心和繁華地帶，沒有形成網絡化的覆蓋，沒有品牌企業(yè)、經營分散、采購渠道多樣。
　　 目前整個醫(yī)藥市場還沒有專門的社會化物流企業(yè)，配送中心一般由醫(yī)藥連鎖企業(yè)自辦，只為組織內連鎖店提供服務。配送中心的功能和作用尚未得到充分發(fā)揮，相當一部分連鎖企業(yè)只是將原有的批發(fā)倉庫簡單地換一個牌子，改名為配送中心，內部組織基本上沒有變化。而且，大多數醫(yī)藥零售企業(yè)的配送中心仍然靠人工手寫的方式進行藥品分揀、包裝、配送，尚未實現配送中心與各零售藥店之間的網絡化管理，無法實現遠程數據、信息的雙向實時交換，對市場缺乏及時、準確、動態(tài)的把握。另一方面在集約化、規(guī)?；?、連鎖經營的形式下，醫(yī)藥商業(yè)企業(yè)為了搶占市場，迅速在各地組織配送人力和運輸工具，爭相建立連鎖配送中心，出現了新一輪的低水平重復建設現象。缺乏相關行業(yè)供應鏈管理技術
　　 我國專業(yè)藥品分銷物流缺乏相關行業(yè)的供應鏈管理技術，還沒有建立配套的藥品物流體系。藥品的研發(fā)、分銷、物流、零售的社會化程度低，行業(yè)上下游企業(yè)合作水平低，藥品流通企業(yè)要12個點的毛利才能保持不虧。藥品沒有規(guī)范統(tǒng)一的條形碼，銀行結算系統(tǒng)尚不完善，信用制度還遠不夠健全等。國際藥品物流分銷企業(yè)集約化程度高、成本低。美國CARDINAL公司設在圣路易斯的物流中心只有7個人，一年卻有15億美元的銷售額，只要1個點的毛利就有利潤空間。
　　 隨著醫(yī)藥連鎖經營業(yè)態(tài)的不斷發(fā)展，以上這些問題將會更加突出，事實上，政府主管部門也認識到中國醫(yī)藥流通領域改革的急迫性。國家政策開始重視扶持醫(yī)藥物流體系建設，外經貿部開始在江蘇、浙江、廣東、北京、天津、重慶、上海、深圳8地開展外資參股物流企業(yè)的試點，同時，原國家經貿委計劃爭取10個國家貼息的醫(yī)藥物流中心建設項目。